7 июля 1918 г. левоэсеровский мятеж был подавлен. Убийцам Мирбаха Блюмкину и Андрееву, а также командиру левоэсеровского отряда ВЧК Попову удалось скрыться, тогда как заместитель председателя ВЧК Вячеслав Александрович был схвачен на Курском вокзале при попытке бежать из Москвы. На следующий день Александрович был расстрелян - кроме него, к смертной казни из организаторов мятежа был заочно приговорен лишь Попов, тогда как большинство организаторов мятежа впоследствии были приговорены к срокам заключения от года до трех. Большинство руководителей ПЛСР были арестованы еще 6 июля в Большом театре, но бывший нарком почт и телеграфа Прош Прошьян ушел в подполье (в том же году умер от тифа). Часть деятелей партии (Натансон, Закс, Колегаев и т.д.), выступивших против мятежа, в последующие недели заявили о разрыве с ПЛСР.